光明科学城发展建设有限公司（简称：光明科学城公司）的股权结构如下：深业集团（代表深圳市国资委，持股60%）、市引导基金（代表深圳市财政局，持股30%）、光明科发集团（代表光明区政府，持股10%），其注册资本总额为100亿元。该公司负责管理光明科学城的总体规划，总面积达99平方公里，其中包括核心区域5平方公里，大型设备集中区12.7平方公里，以及周边的产业转化区、光明中心区等。

光明科学城公司作为构建光明科学城重大科研基础设施“投资、建设、运营、转换”一体化综合平台的关键角色，通过“政府指导、平台整合、市场化运作”的创新模式，推动了深圳新型举国体制的发展。其战略目标是依托世界级的科研基础设施集群与前沿科学研究平台，聚焦信息、生命科学、新材料领域的关键技术，包括关键共性技术、前瞻引领技术、现代工程技术、颠覆性创新技术，实现科技创新、产业创新、制度创新、运营模式创新和协同开放创新的全方位协同。该公司的使命在于吸引全球顶尖的创新资源，促进原创型产业的内部成长，为光明科学城的长远发展注入持续动力。